Javi Venta empezó a jugar en las categorías inferiores del Real Oviedo, club que le cedió al Marino de Luanco que militaba en Segunda división B española. Tras su cesión firmó por el Gimnástica de Torrelavega, equipo en el que jugó dos temporadas, también en la Segunda B.

En el verano de 1999 Javi Venta fue contratado por el Villarreal CF como cedido una temporada en el CD Onda Posteriormente  fue cedido al Racing de Ferrol de la Segunda división española para que continuara la progresión del jugador asturiano.

Tras una buena campaña, volvió a marcharse cedido, esta vez al CD Tenerife de la Primera División. Finalmente, tras tres años en distintos clubes, Javi pasó a integrar la primera plantilla del Villarreal CF la temporada 2002-03, año en el que el jugador no disfruto de demasiadas oportunidades en el terreno de juego, ya que la titularidad en su puesto era para el campeón de la Copa Mundial de Fútbol de 2002 con la Selección de fútbol de Brasil, Juliano Belletti (que posteriormente se fue al Barça y ahora juega en el Chelsea). El año siguiente volvió a disputarse el puesto con el internacional brasileño, aunque logró disfrutar de más oportunidades.

Tras la marcha de Belletti al FC Barcelona en 2004, el club fichó a Armando Sá para cubrir el puesto dejado por el jugador brasileño, pero ese año Venta se hizo finalmente con la titularidad, llegando a disputar 32 encuentros de liga y 9 de Copa de la UEFA.

En la temporada 2005-2006 continuó siendo el lateral derecho con más minutos pese a la contratación del internacional de los Países Bajos Jan Kromkamp primero, y de Josemi después. Al final de la temporada llegó a ir concentrado con la Selección española de fútbol para preparar la Copa Mundial de Fútbol de 2006 en Alemania, aunque finalmente no fue convocado. En la temporada 2006-2007 sufrió varias lesiones que le impidieron disputar un mayor número de partidos.